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台灣歷史數位圖書館（THDL）
目前本資料庫包含「明清臺灣行政檔案」與「古契書」兩文獻集。「明清檔案」約有37,000件全文資料，「古契書」約有24,000筆全文資料。時間涵蓋明清兩代、日治時期及戰後。
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臺灣大學典藏數位化計畫
內容含伊能嘉矩手稿、淡新檔案、田代文庫、狄寶賽文庫、歌仔冊、拓碑。另有臺大校內數位典藏之「植物標本與歷史文獻」、「昆蟲標本與文獻」、「臺灣岩石與地質史料」、「人類學系學術資料」、「臺灣近代醫療文物」等。
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臺灣日治時期統計資料庫
本資料庫以國立臺灣大學圖書館及國立中央圖書館臺灣分館所典藏的日治統計舊籍為收錄對象，共收錄681冊日治時期統計出版品，建置194,075頁數位化影像檔案，103,732筆詮釋資料。
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臺灣省諮議會檔案資料庫
本資料庫包含民國35年至84年間議會相關檔案，計有：總務、民政、財政、教育、經建、主計、提案、質詢等八大類，共89,660筆資料，影像收納範圍則為民國35年到80年，共1,079,019張影幅。
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慈林教育基金會典藏臺灣社運史料資料庫
提供有關臺灣近六十年來自戒嚴時期至解嚴之後的各種國家、政治、社會、環境、人權等方面的相關事件之報導與評論資料。數位全文僅限於慈林教育基金會文教中心與臺大圖書館館內使用。至2008年，該資料庫包含近15萬筆資料，連結約40萬頁之全文影像，其中剪報資料有二萬餘筆，雜誌資料約125,000筆。
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日治法院檔案資料庫（TCCRA）
主要內容為臺北、新竹、臺中、嘉義等四個地方法院所典藏的日治時期各類司法文書，包括民刑事判決原本、民刑事案件登記簿、非訟事件，以及強制執行事件等卷宗、公證書原本、有關法人等的各種登記簿、行政卷宗等檔案，所涉時間始自1895年，迄於1945年。使用者需申請帳號，經審核後使用。
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臺灣舊照片資料庫
本資料庫內容，由臺大圖書館自館藏中挑選與臺灣相關的照片加以數位化，並建置詮釋資料，總計37,000餘筆。
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中國國民黨史料資料庫
本資料庫包涵中國國民黨之「特種檔案」、「漢口檔案」、「近代人物書札」、「中央前五部檔案」（部分）。僅限臺大圖書館館內使用。
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