本次研習主題:
De novo Transcriptome Sequencing Data Analysis Using NTU Galaxy
地點:自動化中心電腦教室
預定課程內容:
8/25 1pm~4pm
1. Introduction to RNA-seq (library preparation and sequencing)
2. Examination of read quality (FastQC)
3. Read filtering and trimming (Trimmomatic)
4. De novo transcriptome assembly (Trinity)
8/26 1pm~4pm
5. Transcript expression quantification (Bowtie2 + eXpress)
6. Transcript annotation (BLASTx)
8/27 1pm~4pm
7. Differential analysis (DESeq)
8. BLASTx output parsing
9. GO analysis
費用:
1. NTU Galaxy 付費使用者(付費主持人實驗室成員):免費
2. 台大校內人士 (教職員/學生/助理/博後等):台幣 300 元/人
3. 校外人士:台幣 600元/人
名額:
40 人
報名網址:http://goo.gl/forms/5AowhzA3wY
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