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本期內容

   NTU Galaxy (http://140.112.94.76/c4galaxy/) 將於 8/25 ~ 8/27 下午 (每日 1pm ~ 4pm,共9小時) 舉辦一個小型研習會,旨於引導 NTU Galaxy 使用者善用適當工具進行特定目的分析。

 

本次研習主題:
De novo Transcriptome Sequencing Data Analysis Using NTU Galaxy

地點:自動化中心電腦教室

預定課程內容:
8/25 1pm~4pm
1. Introduction to RNA-seq (library preparation and sequencing)
2. Examination of read quality (FastQC)
3. Read filtering and trimming (Trimmomatic)
4. De novo transcriptome assembly (Trinity)

8/26 1pm~4pm
5. Transcript expression quantification (Bowtie2 + eXpress)
6. Transcript annotation (BLASTx)

8/27 1pm~4pm
7. Differential analysis (DESeq)
8. BLASTx output parsing
9. GO analysis

費用:
1. NTU Galaxy 付費使用者(付費主持人實驗室成員):免費
2. 台大校內人士 (教職員/學生/助理/博後等):台幣 300 元/人
3. 校外人士:台幣 600元/人

名額:
40 人

 
報名網址:http://goo.gl/forms/5AowhzA3wY

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